RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 Q8NFD4 153 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TSPEARQ8WU66 669 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SDSLQ96GA7 329 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 REEP6Q96HR9 211 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RCHY1Q96PM5 261 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 MICU1Q9BPX6 476 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF649Q9BS31 505 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 YY1AP1Q9H869 796 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 USE1Q9NZ43 259 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 LRP12Q9Y561 859 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PPH5 198 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TVP23AA6NH52 213 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 UNC119BA6NIH7 251 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM210A6NLX4 147 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 C17orf98A8MV24 154 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ARPC3O15145 178 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF823P16415 610 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 GSK3AP49840 483 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC7A2P52569 658 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CAPZA1P52907 286 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TIGD6Q17RP2 521 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CD177Q8N6Q3 437 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2T27Q8NH04 317 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RNF170Q96K19 258 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 P2RX4Q99571 388 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SH3GL1Q99961 368 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 COPS4Q9BT78 406 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 CENPMQ9NSP4 180 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PR64 198 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PRV1 198 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 AMY1AP04745 511 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 AMY2AP04746 511 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CD24P25063 80 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PYCR1P32322 319 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 ENTPD1P49961 510 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC34A1Q06495 639 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PRDX4Q13162 271 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SEC23BQ15437 767 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TAF13Q15543 124 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 KRT77Q7Z794 578 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CALHM1Q8IU99 346 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGGTA-217ENST00000560521 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52D1Q9H346 318 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 VNN3Q9NY84 501 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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