RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555547.5

SRSF5-211, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 5, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF5, Length 2,057 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5-211ENST00000555547 GPR82Q96P67 336 aa8.4□□□□□ -1.06
SRSF5-211ENST00000555547 P2RX4Q99571 388 aa8.4□□□□□ -1.06
SRSF5-211ENST00000555547 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SRSF5-211ENST00000555547 V9GYH0 126 aa8.4□□□□□ -1.06
SRSF5-211ENST00000555547 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.4□□□□□ -1.06
SRSF5-211ENST00000555547 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 DSCR3O14972 297 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 TYMSP04818 313 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 EDN1P05305 212 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 C8orf88P0DMB2 117 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 IL7RP16871 459 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 MST1P26927 711 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 CMPK1P30085 196 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 OR3A4PP47883 348 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 NUMBP49757 651 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 CEACAM7Q14002 265 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 GABRA6Q16445 453 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 EPGNQ6UW88 154 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF534Q76KX8 674 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 COX15Q7KZN9 410 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 RCHY1Q96PM5 261 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 GPR174Q9BXC1 333 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 NAT8Q9UHE5 227 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF785A8K8V0 405 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 OPN1SWP03999 348 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FCARP24071 287 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 MIPP30301 263 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 DNASE1L1P49184 302 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZXDBP98169 803 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 HMGN3Q15651 99 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 CDO1Q16878 200 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 RAB6CQ53S08 254 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 C22orf42Q6IC83 251 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FTMTQ8N4E7 242 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 RTP4Q96DX8 246 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 PEBP4Q96S96 227 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 COPS8Q99627 209 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 DUSP16Q9BY84 665 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 DLL4Q9NR61 685 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ARL15Q9NXU5 204 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ERG28Q9UKR5 140 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 LAMA5O15230 3695 aa8.39□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 H0YIG0 161 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 OR7A17O14581 309 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 HCRTR1O43613 425 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 TPST2O60704 377 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 FARS2O95363 451 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 SIX6O95475 246 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 HTR1FP30939 366 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 HGFACQ04756 655 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 KIR2DS3Q14952 304 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 Q6ZS52 159 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 SLC35G3Q8N808 338 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 BMPERQ8N8U9 685 aa8.38□□□□□ -1.07
SRSF5-211ENST00000555547 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms