RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MED17	Q9NVC6	651 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PRQ8	180 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RNF222	A6NCQ9	220 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	IFITM10	A6NMD0	228 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984		J3QRE1	110 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR2F2	O95006	317 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CH25H	O95992	272 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PTHLH	P12272	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	NID1	P14543	1247 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	KLK2	P20151	261 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	IL11	P20809	199 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CRYGS	P22914	178 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	DDT	P30046	118 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ATP6V1E1	P36543	226 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MNDA	P41218	407 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RAB5C	P51148	216 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RAC1	P63000	192 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ADAM8	P78325	824 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR2F1	Q13607	317 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF614	Q8N883	585 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	COX18	Q8N8Q8	333 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR5W2	Q8NH69	310 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	VDAC3	Q9Y277	283 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984		A0A087X0M5	115 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0J9YW62	118 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GX30	115 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984		A6NLC8	198 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PLPP2	O43688	288 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	RBBP9	O75884	186 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	BCHE	P06276	602 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CD79A	P11912	226 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ACKR3	P25106	362 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	AKR1C3	P42330	323 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SLC6A8	P48029	635 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SMIM11A	P58511	58 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SIRPA	P78324	504 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CD226	Q15762	336 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SZRD1	Q7Z422	152 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	COMTD1	Q86VU5	262 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	GATS	Q8NAP1	163 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	OR10D3	Q8NH80	312 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	ASB13	Q8WXK3	278 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CDS1	Q92903	461 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	S100PBP	Q96BU1	408 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MOAP1	Q96BY2	351 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	TBX5	Q99593	518 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	CHST5	Q9GZS9	411 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	PROCR	Q9UNN8	238 aa		5.67	□□□□□ -1.5
FGD4-215	ENST00000551984	NF1	P21359	2839 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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