RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PIN1P1O15428 100 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CDRT1O95170 752 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 MAS1P04201 325 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CD55P08174 381 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CA6P23280 308 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 SDC2P34741 201 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CD200P41217 278 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 MTCP1P56278 107 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 VBP1P61758 197 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 TESK1Q15569 626 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 DGUOKQ16854 277 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 DDI2Q5TDH0 399 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 DTX2Q86UW9 622 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 MKXQ8IYA7 352 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ITPKCQ96DU7 683 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 RNF170Q96K19 258 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 GPER1Q99527 375 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 SYT3Q9BQG1 590 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 SOX7Q9BT81 388 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 PKIBQ9C010 78 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ROS1P08922 2347 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPK0 400 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 A1L4Q6 167 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 LRP5LA4QPB2 252 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 LRRC30A6NM36 301 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 BPNT1O95861 308 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 DANCRP0C864 163 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ALDH3B1P43353 468 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 GATA4P43694 442 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 NCS1P62166 190 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 KISS1Q15726 138 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 UBE2V2Q15819 145 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 MZT2AQ6P582 158 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 Q8IYB0 196 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 OR5AS1Q8N127 324 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 PXT1Q8NFP0 134 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 HPS1Q92902 700 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CMTM3Q96MX0 182 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 GPR173Q9NS66 373 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 DECR2Q9NUI1 292 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 DSCAMO60469 2012 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 IFITM5A6NNB3 132 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ZNF732B4DXR9 585 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 H3BSH0 61 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 H7C417 338 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 AIPO00170 330 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 SLC17A2O00624 439 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 LMX1BO60663 402 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 PLAUP00749 431 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CALCBP10092 127 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 ANOS1P23352 680 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 HTR2CP28335 458 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 MAGEB1P43366 347 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 IL24Q13007 206 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 INSL4Q14641 139 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 RAB11BQ15907 218 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 CEP78Q5JTW2 689 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-220ENST00000550700 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms