RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RGCCQ9H4X1 137 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DAPL1A0PJW8 107 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 METTL15A6NJ78 407 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ACOD1A6NK06 481 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 H3BSH0 61 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 FAM20BO75063 409 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 IGHV2-70P01814 119 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 TTRP02766 147 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KRT8P05787 483 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PSMB10P40306 273 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CDH15P55291 814 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 IL5RAQ01344 420 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZNF85Q03923 595 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZMYND11Q15326 602 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OR8B8Q15620 311 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ODF4Q2M2E3 257 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 TP53I3Q53FA7 332 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 TMEM177Q53S58 311 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OR8S1Q8NH09 359 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 LGALS12Q96DT0 336 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 Q96MT0 163 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GPR84Q9NQS5 396 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 R4GMQ9 66 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 VWFP04275 2813 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 A0A0U1RQV5 110 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 A6NIN4 97 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 A6NLC8 198 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 LRRC30A6NM36 301 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SNTNA6NMZ2 147 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 B4DSR2 109 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PPIAL4DF5H284 164 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 P2RY10O00398 339 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MPZL2O60487 215 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 IGHV2-5P01817 119 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 IRF2P14316 349 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OR12D2P58182 307 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 BTG1P62324 171 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZNF91Q05481 1191 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PRDX4Q13162 271 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 WDR86Q86TI4 376 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KLBQ86Z14 1044 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SPERTQ8NA61 448 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 APH1BQ8WW43 257 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 RORBQ92753 470 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 RAB39BQ96DA2 213 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 RDH12Q96NR8 316 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 TMEM165Q9HC07 324 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PRR13Q9NZ81 148 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GNG8Q9UK08 70 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 A0A0A6YYJ9 748 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GTI1 187 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 TMEM89A2RUT3 159 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 J3QLW9 94 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 J3QRE1 110 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 IFNL4K9M1U5 179 aa8.05□□□□□ -1.12
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