RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549194.1

GNPTAB-204, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-204ENST00000549194 FZD2Q14332 565 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ARL6IP1Q15041 203 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PPA1Q15181 289 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SHBQ15464 509 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SGCAQ16586 387 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MLANAQ16655 118 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MST1LQ2TV78 715 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RTL6Q6ICC9 239 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 POC1AQ8NBT0 407 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 NUBPLQ8TB37 319 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ST8SIA1Q92185 356 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF524Q96C55 264 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MVB12AQ96EY5 273 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR5B2Q96R09 309 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MAP3K3Q99759 626 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MICU1Q9BPX6 476 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RNF122Q9H9V4 155 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RHOFQ9HBH0 211 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PDE7BQ9NP56 450 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PARP11Q9NR21 331 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 KPTNQ9Y664 436 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 FRYQ5TBA9 3013 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PTPRBP23467 1997 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TLCD2A6NGC4 264 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 B4DGG1 531 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 MFNGO00587 321 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CA11O75493 328 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TTRP02766 147 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF883P0CG24 379 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SMIM6P0DI80 62 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CD59P13987 128 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PNLIPP16233 465 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GNB3P16520 340 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 NPBWR1P48145 328 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SULT1A2P50226 295 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CLDN6P56747 220 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RNF212Q495C1 297 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR52W1Q6IF63 320 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TMED6Q8WW62 240 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CMBLQ96DG6 245 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 RAB3CQ96E17 227 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CHST11Q9NPF2 352 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 CENPMQ9NSP4 180 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-204ENST00000549194 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.28□□□□□ -1.24
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