RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STEAP2Q8NFT2 490 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLAMF6Q96DU3 332 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR8B4Q96RC9 309 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABHD1Q96SE0 405 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF416Q9BWM5 594 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXL3Q9UKT7 428 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COPS3Q9UNS2 423 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.9□□□□□ -1.62
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.9□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ESPL1Q14674 2120 aa4.9□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMIM30A4D0T7 59 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MV72 311 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 E9PLN8 166 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BSA7 217 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SGCEO43556 437 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GMDSO60547 372 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL18BPO95998 194 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERPINA5P05154 406 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MALP21145 153 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD40LGP29965 261 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GABRA5P31644 462 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCTDP32321 178 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TGM4P49221 684 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPTEP56180 551 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TLE1Q04724 770 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPBGQ13641 420 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCK2Q16822 640 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CR1LQ2VPA4 569 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BEX5Q5H9J7 111 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ELFN2Q5R3F8 820 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARL9Q6T311 187 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRN1Q6UXK5 716 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZT83 130 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDFY1Q8IWB7 410 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDNFQ8TB73 568 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RND1Q92730 232 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATF6BQ99941 703 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACNG6Q9BXT2 260 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 METTL9Q9H1A3 318 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COA4Q9NYJ1 87 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STUB1Q9UNE7 303 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRP12Q9Y561 859 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LOC400499M0QZD8 3231 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPRP12270 2363 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PQLC2LA1A4F0 135 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR6C6A6NF89 314 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM212A6NML5 194 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LGALS8O00214 317 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OGG1O15527 345 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLPP2O43688 288 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WISP2O76076 250 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFNA6P05013 189 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD1AP06126 327 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HNF1AP20823 631 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPT2P23786 658 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCH1P30793 250 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APLNRP35414 380 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LIPAP38571 399 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSMB10P40306 273 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HTR5AP47898 357 aa4.89□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERPINB10P48595 397 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 581.3 ms