RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 CPT2P23786 658 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CD80P33681 288 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 GPM6AP51674 278 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 GNG3P63215 75 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 RIPK1Q13546 671 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 C19orf18Q8NEA5 215 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 OR5A2Q8NGI9 324 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC29Q8WV35 223 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 NF1P21359 2839 aa15.92■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 OOEPA6NGQ2 149 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF732B4DXR9 585 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXH1O75593 365 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP6V1G2O95670 118 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ISG15P05161 165 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 WNT2P09544 360 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF12P17014 697 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 EGR1P18146 543 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 PCMT1P22061 227 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CFHR2P36980 270 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CR1LQ2VPA4 569 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DMRTC1Q5HYR2 192 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DCDC5Q6ZRR9 648 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 RDH10Q8IZV5 341 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SCCPDHQ8NBX0 429 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 POM121Q96HA1 1249 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR173Q9NS66 373 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MIOXQ9UGB7 285 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.91■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 A6NIN4 97 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 A8MXK9 166 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SRRM5B3KS81 715 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 C3orf80F5H4A9 247 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 MYL12AP19105 171 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ETV1P50549 477 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNJ8Q15842 424 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM120AOSQ5T036 256 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX36Q5VZQ5 186 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFB108BQ8NET1 73 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 GGHQ92820 318 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 C10orf35Q96D05 121 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM80Q96HE8 168 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 SHARPINQ9H0F6 387 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 OR51I2Q9H344 312 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 LRCH1Q9Y2L9 728 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFHX3Q15911 3703 aa15.9■□□□□ 0.14
PACSIN3-208ENST00000531226 EFCAB10A6NFE3 127 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 E9PI62 339 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 XPNPEP2O43895 674 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 TGM4P49221 684 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 LCN2P80188 198 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 MED21Q13503 144 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ESCO2Q56NI9 601 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 OR8B3Q8NGG8 313 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 OR8B2Q96RD0 313 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CHST5Q9GZS9 411 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 HHLA2Q9UM44 414 aa15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC159P0C7I6 412 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 HNF1AP20823 631 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ST3GAL4Q11206 333 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 LYPD2Q6UXB3 125 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM90A1Q86YD7 464 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF676Q8N7Q3 588 aa15.88■□□□□ 0.13
PACSIN3-208ENST00000531226 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.88■□□□□ 0.13
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