RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 CYB5BO43169 146 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SCGB1D2O95969 90 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 KNG1P01042 644 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 FOLR1P15328 257 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SERPINA2P20848 420 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 HOXA6P31267 233 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SFTPDP35247 375 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SRPXP78539 464 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NHLH2Q02577 135 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TLE4Q04727 773 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 GAMTQ14353 236 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NFATC4Q14934 902 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TAF9Q16594 264 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 GAB4Q2WGN9 574 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 KHDC3LQ587J8 217 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 CBLN3Q6UW01 205 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 Q8WTZ3 238 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NEU1Q99519 415 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NICN1Q9BSH3 213 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 CENPMQ9NSP4 180 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 OBP2AQ9NY56 170 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 PADI1Q9ULC6 663 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.65□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CLDN34H7C241 214 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SOCS1O15524 211 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HCRTR2O43614 444 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 NPIPB7O75200 414 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DFFBO76075 338 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 NUDT14O95848 222 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OPN1MWP04001 364 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HCKP08631 526 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5AC1P0C628 307 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FABP4P15090 132 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 MYOGP15173 224 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PI3P19957 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GABRR1P24046 479 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 IL12BP29460 328 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 AKT2P31751 481 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CSNK1A1P48729 337 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 RND2P52198 227 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM50BP56557 158 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF4P78317 190 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DLK1P80370 383 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 NNATQ16517 81 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DOK3Q7L591 496 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GRINAQ7Z429 371 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 LGI3Q8N145 548 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.64□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM234Q8WY98 164 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms