RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521941.1

CTNNA1-231, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 3

Gene CTNNA1, Length 224 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-231	ENST00000521941	ABCB9	Q9NP78	766 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MMP26	Q9NRE1	261 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CLN8	Q9UBY8	286 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		V9GYS6	101 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A1B0GW55	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		A8MXK9	166 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		H0YHG0	523 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMPRSS2	O15393	492 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RHBDL1	O75783	438 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	INMT	O95050	263 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PLAT	P00750	562 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	AVP	P01185	164 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TFF1	P04155	84 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ACTA2	P62736	377 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GNG3	P63215	75 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ACTG2	P63267	376 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	KCNJ8	Q15842	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CDON	Q4KMG0	1287 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TTC23	Q5W5X9	447 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RDH10	Q8IZV5	341 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SETD9	Q8NE22	299 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ST8SIA4	Q92187	359 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MRI1	Q9BV20	369 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OCEL1	Q9H607	264 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	C8orf4	Q9NR00	106 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DUX4	Q9UBX2	424 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR5B21	A6NL26	309 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SRRM5	B3KS81	715 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		J3QRE1	110 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	IGHA1	P01876	353 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GNAO1	P09471	354 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SELL	P14151	372 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF12	P17014	697 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF20	P17024	532 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	EPHA1	P21709	976 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CCL1	P22362	96 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GLRA1	P23415	457 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CAPG	P40121	348 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	HAAO	P46952	286 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GABRA2	P47869	451 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ISL1	P61371	349 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RAB40B	Q12829	278 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	IKZF1	Q13422	519 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GALE	Q14376	348 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MICB	Q29980	383 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FGFRL1	Q8N441	504 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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