RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, human

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGGT1B-205	ENST00000514178	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178		A0A1B0GW15	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	UPK1B	O75841	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	GALR1	P47211	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	KCNJ3	P48549	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	XRCC4	Q13426	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGGT1B-205	ENST00000514178	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	B4GALT5	O43286	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SPAG7	O75391	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	YIF1A	O95070	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	CD9	P21926	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	MNAT1	P51948	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178		Q8N7P7	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	RAD51B	O15315	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	LIPC	P11150	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	TAAR5	O14804	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SOCS1	O15524	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	SERPINB7	O75635	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	CST4	P01036	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	CXCR1	P25024	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	STX3	Q13277	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	PNOC	Q13519	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	UBE2S	Q16763	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PGGT1B-205	ENST00000514178	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms