RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 CHST5Q9GZS9 411 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 UFSP2Q9NUQ7 469 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 LRP5LA4QPB2 252 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV2-70P01814 119 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 MDH2P40926 338 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNJ8Q15842 424 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 UTS2BQ765I0 119 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 PRSS48Q7RTY5 328 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 CD1AP06126 327 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 GPM6AP51674 278 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 GABARAPL2P60520 117 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 ACSM1Q08AH1 577 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP78Q5JTW2 689 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF573Q86YE8 665 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10Z1Q8NGY1 313 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR148Q8TDV2 347 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 DHDHQ9UQ10 334 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIAL4EA0A075B759 164 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ISPDA4D126 451 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF732B4DXR9 585 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIAL4DF5H284 164 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CD2P06729 351 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 THBS2P35442 1172 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PMELP40967 661 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 AVPI1Q5T686 147 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CLDND2Q8NHS1 167 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 GAL3ST1Q99999 423 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR173Q9NS66 373 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF281Q9Y2X9 895 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 FUT6P51993 359 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 IRF3Q14653 427 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 SPHARQ15513 63 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR86Q86TI4 376 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINA12Q8IW75 414 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAAF1Q8NEP3 725 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF671Q8TAW3 534 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 THRSPQ92748 146 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 FGGYQ96C11 551 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51I2Q9H344 312 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PLPP2O43688 288 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKACBP22694 351 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 YIF1BQ5BJH7 314 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CYB5R2Q6BCY4 276 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5D14Q8NGL3 314 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 SPSB1Q96BD6 273 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf159Q96HA4 380 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC90BQ9GZT6 254 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 DCAF16Q9NXF7 216 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHB10Q9UN67 800 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 H3BSH0 61 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CDIPTO14735 213 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ALX3O95076 343 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 OCM2P0CE71 109 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ZMYND11Q15326 602 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 XAF1Q6GPH4 301 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CLEC9AQ6UXN8 241 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR82Q6UXN9 313 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 C11orf53Q8IXP5 236 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PARP16Q8N5Y8 322 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 SCCPDHQ8NBX0 429 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 GHSRQ92847 366 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 UBAP1Q9NZ09 502 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 PQLC2LA1A4F0 135 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 A6NIN4 97 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 LGALS8O00214 317 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 NDUFA2O43678 99 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CD5LO43866 347 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 LALBAP00709 142 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 LHBP01229 141 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51A4Q8NGJ6 313 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10AC1Q8NH08 325 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC29Q8WV35 223 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ISYNA1Q9NPH2 558 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCA1O95477 2261 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 MT-ND2P03891 347 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms