RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR52W1Q6IF63 320 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR2T12Q8NG77 320 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ST8SIA4Q92187 359 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 P2RX4Q99571 388 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 KRT36O76013 467 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 GSK3AP49840 483 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP10-11P60412 298 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 EBI3Q14213 229 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF596Q8TC21 504 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF823P16415 610 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCL1P22362 96 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 GNG3P63215 75 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 BDH1Q02338 343 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 LYPD6Q86Y78 171 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SGK3Q96BR1 496 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PITX2Q99697 317 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MUC13Q9H3R2 512 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MEIOCA2RUB1 952 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCRL2O00421 344 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 AQP1P29972 269 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 GNALP38405 381 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 IL24Q13007 206 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 KIR2DS1Q14954 304 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DGUOKQ16854 277 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 RNF148Q8N7C7 305 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FANK1Q8TC84 345 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 KRT84Q9NSB2 600 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR2AT4A6NND4 320 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 LY6LH3BQJ8 138 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CHRM2P08172 466 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 C1QL4Q86Z23 238 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 Q8IYB0 196 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR8S1Q8NH09 359 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SGCDQ92629 289 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 REEP6Q96HR9 211 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCL13Q99616 98 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 EBF4Q9BQW3 602 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 J3QT63 122 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 THBS3P49746 956 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FHL3Q13643 280 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 AQP3Q92482 292 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 GON7Q9BXV9 100 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR52D1Q9H346 318 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms