RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-208	ENST00000493601	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRU-208	ENST00000493601	LRP12	Q9Y561	859 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRU-208	ENST00000493601	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		M0R1W7	72 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	AKR7A2	O43488	359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	E2F6	O75461	281 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PAH	P00439	452 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OSM	P13725	252 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	AMY2B	P19961	511 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	GPM6A	P51674	278 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CAV3	P56539	151 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PROK1	P58294	105 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		Q8N7P7	452 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A0U1RQV5	110 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PQ09	198 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SIGLEC5	O15389	551 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	NDUFB7	P17568	137 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC2A5	P22732	501 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	DCTD	P32321	178 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	MAP2K3	P46734	347 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	GNG3	P63215	75 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CDK5	Q00535	292 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	KLRD1	Q13241	179 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	BLMH	Q13867	455 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TAF9	Q16594	264 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	DGUOK	Q16854	277 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	GLRA1	P23415	457 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SAA4	P35542	130 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TGFBR2	P37173	567 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	UBE2E1	P51965	193 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		Q6ZSV7	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PRD5	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PRF3	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PRM7	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OR5B21	A6NL26	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	RHBDL1	O75783	438 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM107A	O95990	144 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TFF1	P04155	84 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ANXA8	P13928	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	GABRA2	P47869	451 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	DLX1	P56177	255 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	APOF	Q13790	326 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	KRT74	Q7RTS7	529 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.6	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms