RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR2M5A3KFT3 312 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C5orf63A6NC05 138 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 AQP8O94778 261 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB6O95139 128 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 NMBP08949 121 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FOLR3P41439 243 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MMP16P51512 607 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SSR4P51571 173 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FAM166AQ6J272 317 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FAM57BQ71RH2 274 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CYYR1Q96J86 154 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OXGR1Q96P68 337 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DKKL1Q9UK85 242 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JMM0 328 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PNV4 684 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPB8 328 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRS3 328 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 F5H5K5 113 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GPR31O00270 319 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TCN2P20062 427 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 BDKRB2P30411 391 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A9P48067 706 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RAG2P55895 527 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PMPCAQ10713 525 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PCK2Q16822 640 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GALNT16Q8N428 558 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SEH1LQ96EE3 360 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 EXO5Q9H790 373 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TCFL5Q9UL49 500 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TMEM82A0PJX8 343 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MEGF11A6BM72 1044 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MPTX1A8MV57 137 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RAB3DO95716 219 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 IL18BPO95998 194 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 AMY2AP04746 511 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CSF1P09603 554 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 AKAIN1P0CW23 69 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF20P17024 532 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 AKR1C2P52895 323 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PRSS12P56730 875 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 AKR1C1Q04828 323 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CD163Q86VB7 1156 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FADS6Q8N9I5 356 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GPR84Q9NQS5 396 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PISDQ9UG56 409 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 BSNQ9UPA5 3926 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR14I1A6ND48 311 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF878C9JN71 531 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF11O14788 317 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZIC3O60481 467 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SLC35A1P78382 337 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 C11orf88Q6PI97 169 aa6.15□□□□□ -1.43
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