RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	MAGEB3	O15480	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF208	O43345	1280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2T1	O43869	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	REN	P00797	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHE	P01854	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RAF1	P04049	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	COX6A1	P12074	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CCL4	P13236	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	F8A1	P23610	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CCKAR	P32238	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SDC2	P34741	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SFTPD	P35247	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TIMP3	P35625	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TGM4	P49221	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CLDN17	P56750	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR12D2	P58182	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PON3	Q15166	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF79	Q15937	498 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	M1AP	Q8TC57	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TBX5	Q99593	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ATF6B	Q99941	703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MMP28	Q9H239	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SP140L	Q9H930	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		C9J4A7	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		J3QLW9	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	BMPR1B	O00238	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	DCTN6	O00399	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PLPP3	O14495	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PHYH	O14832	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	EFNA2	O43921	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	GPRIN2	O60269	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	AHSA1	O95433	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	NUDT14	O95848	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SERPINA3	P01011	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CRYAA	P02489	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OCM2	P0CE71	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF19	P17023	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	GRPR	P30550	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PYCR1	P32322	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms