RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TNFRSF14Q92956 283 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 AJUBAQ96IF1 538 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TBX5Q99593 518 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GPR84Q9NQS5 396 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GPR173Q9NS66 373 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 POMPQ9Y244 141 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OR2AT4A6NND4 320 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 F8VVB4 439 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 F8VWA3 439 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 NPFFO15130 113 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 NDUFB3O43676 98 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TTRP02766 147 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CALCBP10092 127 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PSG2P11465 335 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CCL3L1P16619 93 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DDOSTP39656 456 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FLOT2Q14254 428 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SNAPC1Q16533 368 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PLA1AQ53H76 456 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RNF144BQ7Z419 303 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 COMMD2Q86X83 199 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LYG1Q8N1E2 194 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SPERTQ8NA61 448 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CITED1Q99966 193 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MICU1Q9BPX6 476 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OR51I2Q9H344 312 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MUC13Q9H3R2 512 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TOR3AQ9H497 397 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 NIPAL2Q9H841 368 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF222Q9UK12 451 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RNF114Q9Y508 228 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GTI1 187 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 MEIOCA2RUB1 952 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 GYG2O15488 501 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CST4P01036 141 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV3-1P01715 115 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CRYBA1P05813 215 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 GLRA1P23415 457 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 COX7A1P24310 79 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 RAB13P51153 203 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 BMXP51813 675 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 MNAT1P51948 309 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CRISP1P54107 249 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 PROK1P58294 105 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF273Q14593 569 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 PDCD1Q15116 288 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 KCNJ8Q15842 424 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CALHM1Q8IU99 346 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 MKXQ8IYA7 352 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-211ENST00000491581 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.27□□□□□ -1.25
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