RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483512.5

CNIH3-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, human

TSL 2

Gene CNIH3, Length 968 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNIH3-208	ENST00000483512	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	SDSL	Q96GA7	329 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	ZNF799	Q96GE5	643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	HERC1	Q15751	4861 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	AKR7A2	O43488	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	OR2F2	O95006	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	IFI30	P13284	250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	GABRA2	P47869	451 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	TAS2R41	P59536	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	ZNF273	Q14593	569 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	RFX4	Q33E94	735 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	RCN3	Q96D15	328 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	LY6G6C	O95867	125 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	PSG2	P11465	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	CD24	P25063	80 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	DDOST	P39656	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	OR1E2	P47887	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	OAF	Q86UD1	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	RNFT2	Q96EX2	444 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CNIH3-208	ENST00000483512	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	DCTN6	O00399	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	SLC9A3	P48764	834 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	PTP4A3	O75365	173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	ZNF823	P16415	610 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CAPZA1	P52907	286 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	FHL3	Q13643	280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512		M0QZK8	103 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	RBP4	P02753	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	GNAL	P38405	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	MTNR1B	P49286	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	CENPA	P49450	140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CNIH3-208	ENST00000483512	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms