RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 LAMTOR5O43504 91 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TIAF1O95411 115 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SEMA4FO95754 770 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 MT-ATP6P00846 226 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 IL2RAP01589 272 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHA1P01876 353 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF286BP0CG31 522 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 AKR1C4P17516 323 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OMGP23515 440 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 UCP1P25874 307 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GABRA3P34903 492 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 MPLP40238 635 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 NBL1P41271 181 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PPICP45877 212 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TPPP2P59282 170 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PLP1P60201 277 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB103AP81534 67 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OLIG2Q13516 323 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DUSP5Q16690 384 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 NXPE1Q8N323 547 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 C10orf111Q8N326 155 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SEH1LQ96EE3 360 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ALG14Q96F25 216 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 RAX2Q96IS3 184 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HARBI1Q96MB7 349 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GABRG3Q99928 467 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SGK2Q9HBY8 427 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 NOX4Q9NPH5 578 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CLDND1Q9NY35 253 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GALPQ9UBC7 116 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR45Q9Y484 360 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 YIPF1Q9Y548 306 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ETV7Q9Y603 341 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LEFTY2O00292 366 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GRM6O15303 877 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TMPRSS11DO60235 418 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF205O95201 554 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CH25HO95992 272 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4Q2P0C623 313 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LYL1P12980 280 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CR2P20023 1033 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 KITLGP21583 273 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DUSP1P28562 367 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 P2RY2P41231 377 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR12P47775 334 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PRLHRP49683 370 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SRPXP78539 464 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HLA-DRB3P79483 266 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HMGCS1Q01581 520 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DHRS2Q13268 280 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 INSL4Q14641 139 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 UPP1Q16831 310 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM177Q53S58 311 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CARD17Q5XLA6 110 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LEG1Q6P5S2 330 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR82Q6UXN9 313 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMF1Q92530 271 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR6C1Q96RD1 312 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 FGF21Q9NSA1 209 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DECR2Q9NUI1 292 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms