RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	PRKY	O43930	277 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP5H	O75947	161 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	MELTF	P08582	738 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	GNG3	P63215	75 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT77	Q7Z794	578 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	MED30	Q96HR3	178 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	CCL13	Q99616	98 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A1B0GW55	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307		M0R1W7	72 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	CCL1	P22362	96 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	EPHA2	P29317	976 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RASSF2	P50749	326 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ARF6	P62330	175 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	EGR3	Q06889	387 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307		Q8N7P7	452 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	AQP3	Q92482	292 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	SDSL	Q96GA7	329 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF170	Q96K19	258 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	BRD7	Q9NPI1	651 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DUX4	Q9UBX2	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307		V9GYS6	101 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307		E9PQ18	207 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307		G3V2T6	193 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	NDUFB3	O43676	98 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DHRS3	O75911	302 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	TTR	P02766	147 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	FCGR1A	P12314	374 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	MPZ	P25189	248 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	FAS	P25445	335 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	HCCS	P53701	268 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	TMED1	Q13445	227 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	PIGC	Q92535	297 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	DYRK2	Q92630	601 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	SEH1L	Q96EE3	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	CHIA	Q9BZP6	476 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	NLK	Q9UBE8	527 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	AP4S1	Q9Y587	144 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307		R4GMQ9	66 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PGAP2-215	ENST00000469307	NOTCH1	P46531	2555 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PGAP2-215	ENST00000469307	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A1B0GTI1	187 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PGAP2-215	ENST00000469307	OR2AT4	A6NND4	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PGAP2-215	ENST00000469307	DLGAP1	O14490	977 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PGAP2-215	ENST00000469307	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79

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