RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 AGFG2O95081 481 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 TECTBQ96PL2 329 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 TMEM235A6NFC5 223 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PROB1E7EW31 1015 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.82□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 MED20Q9H944 212 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 DLL4Q9NR61 685 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.82□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 J3QRE1 110 aa6.82□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TVP23CQ96ET8 276 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR51M1Q9H341 326 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.82□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 DCTN6O00399 190 aa6.82□□□□□ -1.32
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