RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-12P01611 117 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZPA2 131 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 HOGA1Q86XE5 327 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GVQW1Q8N7I0 195 aa4.88□□□□□ -1.63
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