RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.12□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF732B4DXR9 585 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CDIPTO14735 213 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CSNK2BP67870 215 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GGHQ92820 318 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 POM121Q96HA1 1249 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM80Q96HE8 168 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51I2Q9H344 312 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 OOEPA6NGQ2 149 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MXK9 166 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
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RABGEF1-204ENST00000442563 TGM4P49221 684 aa14.1□□□□□ -0.15
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RABGEF1-204ENST00000442563 MED21Q13503 144 aa14.1□□□□□ -0.15
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RABGEF1-204ENST00000442563 CR1LQ2VPA4 569 aa14.1□□□□□ -0.15
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RABGEF1-204ENST00000442563 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.1□□□□□ -0.15
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RABGEF1-204ENST00000442563 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.09□□□□□ -0.15
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RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM212A6NML5 194 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 J3QLI3 93 aa14.08□□□□□ -0.16
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF573Q86YE8 665 aa14.08□□□□□ -0.16
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RABGEF1-204ENST00000442563 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.08□□□□□ -0.16
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RABGEF1-204ENST00000442563 PP6455Q8WZ26 134 aa14.08□□□□□ -0.16
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RABGEF1-204ENST00000442563 CHST5Q9GZS9 411 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR173Q9NS66 373 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFHX3Q15911 3703 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.07□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.07□□□□□ -0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 A6NIN4 97 aa14.07□□□□□ -0.16
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