RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ZNF254O75437 659 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TOX4O94842 621 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 RPP14O95059 124 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 IGLV3-1P01715 115 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 PRTN3P24158 256 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DCTDP32321 178 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MAP2K3P46734 347 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DLX1P56177 255 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ARF6P62330 175 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SNCBQ16143 134 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ODF4Q2M2E3 257 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 AWAT1Q58HT5 328 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GPR157Q5UAW9 335 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CD276Q5ZPR3 534 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 STUMQ69YW2 141 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MOB3CQ70IA8 216 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 BATF2Q8N1L9 274 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 WDFY2Q96P53 400 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GABARAPL3Q9BY60 117 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SIRPDQ9H106 197 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CLN6Q9NWW5 311 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A13Q9Y226 551 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 H3BNX3 289 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 P2RY10O00398 339 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 METTL11BQ5VVY1 283 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GID4Q8IVV7 300 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 LHX4Q969G2 390 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNF488Q96MN9 340 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GAFA1Q96PS6 74 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ABCB9Q9NP78 766 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GPR173Q9NS66 373 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 R4GMQ9 66 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ACOD1A6NK06 481 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GLRA1P23415 457 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MTNR1AP48039 350 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DGUOKQ16854 277 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 C3orf56Q8N813 242 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 YIPF7Q8N8F6 280 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 UBE2FQ969M7 185 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 EME1Q96AY2 570 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 OR51I2Q9H344 312 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 AASSQ9UDR5 926 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 OR52A1Q9UKL2 312 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GTI1 187 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 EI24O14681 340 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 NDUFB3O43676 98 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SYNGR1O43759 233 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DHRS3O75911 302 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 HTR1FP30939 366 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GABRA2P47869 451 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ACTR3P61158 418 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 GNG3P63215 75 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNF788Q6ZQV5 615 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ELMOD2Q8IZ81 293 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 252.5 ms