RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCN7AQ01118 1682 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTDAPP60985 99 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR27Q6MZM9 219 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPIL1Q9Y3C6 166 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSF2RBP32927 897 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PJVKQ0ZLH3 352 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MBTPS2O43462 519 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERVFC1-1P60608 527 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLA1AQ53H76 456 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEURL2Q9BR09 285 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LY86O95711 162 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MDH2P40926 338 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCL7P80098 99 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGFBP7Q16270 282 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM230Q96A57 120 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTFP1Q9UDX5 166 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PGA3P0DJD8 388 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR34Q96EX3 536 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXQ1Q9C009 403 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NHSQ6T4R5 1651 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYBPHQ13203 477 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ONECUT2O95948 504 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSX1Q16384 188 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GSG1Q2KHT4 349 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBE3DQ7Z6J8 389 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS25Q9BRG1 176 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CTAG2O75638 210 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SEMG1P04279 462 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VAMP3Q15836 100 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CARFQ8N187 725 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPAN32Q96QS1 320 aa13.36□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITGB4P16144 1822 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf170A2RU37 121 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DHRS3O75911 302 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GP1BAP07359 652 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NQO2P16083 231 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNB2P62879 340 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LHX8Q68G74 356 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR10AD1Q8NGE0 317 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LIMK1P53667 647 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTTG1IPP53801 180 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF793Q6ZN11 406 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAP6Q96JE9 813 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIAS2O75928 621 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CST7O76096 145 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPANK1O95872 356 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VMA21Q3ZAQ7 101 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C4orf45Q96LM5 186 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA0040Q15053 153 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLEC12BQ2HXU8 276 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXL14Q8N1E6 418 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGF14Q92915 247 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB40CQ96S21 281 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C20orf141Q9NUB4 165 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UQCC1Q9NVA1 299 aa13.35□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALG1L2C9J202 215 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNG3P63215 75 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KISS1Q15726 138 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL11RAQ14626 422 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR8D4Q8NGM9 314 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VAMP8Q9BV40 100 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKAP11Q9UKA4 1901 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BP45 60 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADAM20O43506 726 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDC14BO60729 498 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPPINO95925 133 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHA2P01877 340 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GABRG2P18507 467 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCMT1P22061 227 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD96P40200 585 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIR2DS2P43631 304 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GALR1P47211 349 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSX7Q7RTT5 188 aa13.34□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms