RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CACNA1GO43497 2377 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF735P0CB33 412 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ERP29P30040 261 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 Q5BKY6 102 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CDH24Q86UP0 819 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 GHRLQ9UBU3 117 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF175Q9Y473 711 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 XRCC2O43543 280 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CDK10Q15131 360 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 OR8B8Q15620 311 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 HRH1P35367 487 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MECP2P51608 486 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM42Q69YG0 159 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 BORCS8Q96FH0 119 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 APC2O95996 2303 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MEIKINA0A087WXM9 373 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 PLCXD3Q63HM9 321 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF626Q68DY1 528 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MOB3CQ70IA8 216 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 TMED4Q7Z7H5 227 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 OR1K1Q8NGR3 316 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CHIAQ9BZP6 476 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 POFUT1Q9H488 388 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ATPIF1Q9UII2 106 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 KLK10O43240 276 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CEACAM4O75871 244 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 NGFP01138 241 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MPGP29372 298 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 RBP2P50120 134 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SNAPC3Q92966 411 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CA10Q9NS85 328 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CLCF1Q9UBD9 225 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MFNGO00587 321 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 IL5P05113 134 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 PRKACBP22694 351 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 GABRR1P24046 479 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ARR3P36575 388 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 LIX1LQ8IVB5 337 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 SPSB4Q96A44 273 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 TAAR6Q96RI8 345 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 OR51B6Q9H340 312 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 OR3A2P47893 321 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 CXADRP78310 365 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ARFRP1Q13795 201 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 C17orf107Q6ZR85 190 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 OR13C8Q8NGS7 320 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 MED30Q96HR3 178 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 CRIM1Q9NZV1 1036 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ATMQ13315 3056 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF850A8MQ14 1090 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 AKR7A2O43488 359 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 HTR3BO95264 441 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 PMP2P02689 132 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 PLP2Q04941 152 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 RSU1Q15404 277 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 C4orf46Q504U0 113 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 GPR160Q9UJ42 338 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PR80 420 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM82A0PJX8 343 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 OR14I1A6ND48 311 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 MEF2DQ14814 521 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 STEAP2Q8NFT2 490 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 OR11H4Q8NGC9 324 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 DLL4Q9NR61 685 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF581Q9P0T4 197 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-209ENST00000428120 STARD10Q9Y365 291 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms