RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 GIMD1P0DJR0 217 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 AKR1C4P17516 323 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NTSP30990 170 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FCGR2CP31995 323 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ARR3P36575 388 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ALDH3B1P43353 468 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FXYD6P3P58550 94 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 BTG2P78543 158 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CDK3Q00526 305 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 COL10A1Q03692 680 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 HSPB3Q12988 150 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RAB32Q13637 225 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 SGCBQ16585 318 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MORN2Q502X0 79 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM64Q6YI46 380 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 KMT5CQ86Y97 462 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LYG1Q8N1E2 194 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF738Q8NE65 137 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR2M7Q8NG81 312 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 AQP3Q92482 292 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM159Q96B96 161 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 RNF2Q99496 336 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MCHR1Q99705 422 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
LINC00501-201ENST00000425388 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 HSPB2A8KAH6 182 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 DNPH1O43598 174 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 B4GALT2O60909 372 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 WDR1O75083 606 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SCGB2A1O75556 95 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CT45A8P0DMV1 189 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CT45A9P0DMV2 189 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CD40P25942 277 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 EFNB2P52799 333 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SLC25A1P53007 311 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM33P57088 247 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 HSPB2Q16082 182 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 UPP1Q16831 310 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR13H1Q8NG92 308 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RNF128Q8TEB7 428 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FGF13Q92913 245 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TSLPQ969D9 159 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PTX4Q96A99 478 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 C5orf30Q96GV9 206 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 A0A1B0GU03 582 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CATP04040 527 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MAS1P04201 325 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF28P17035 718 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SLC6A6P31641 620 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 S100A10P60903 97 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 BATFQ16520 125 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GPR119Q8TDV5 335 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CDS1Q92903 461 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms