RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MSX1P28360 303 aa16.42■□□□□ 0.22
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A53Q5H9E4 307 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 DRAM2Q6UX65 266 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.42■□□□□ 0.22
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SH3BP1-202ENST00000417536 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.39■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf50Q96LR7 162 aa16.39■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF160Q9HCG1 818 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LNP1A1A4G5 178 aa16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP1-202ENST00000417536 RPS2P15880 293 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM189A2Q15884 450 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST3H3Q16695 136 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 HFEQ30201 348 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 POC1AQ8NBT0 407 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 IER2Q9BTL4 223 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 CRB3Q9BUF7 120 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LYL1P12980 280 aa16.37■□□□□ 0.21
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