RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PHF21AQ96BD5 680 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GFI1Q99684 422 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CXXC4Q9H2H0 198 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CNTD2Q9H8S5 307 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ING4Q9UNL4 249 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 COL6A6A6NMZ7 2263 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PLATP00750 562 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR4A8P0C604 315 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 UBBP0CG47 229 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINF1P36955 418 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF81P51508 661 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 BMXP51813 675 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CLDN12P56749 244 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 P2RY14Q15391 338 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ADIPOQQ15848 244 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 KRT74Q7RTS7 529 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 LRP11Q86VZ4 500 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR2Z1Q8NG97 314 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR51D1Q8NGF3 324 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR5D18Q8NGL1 313 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR5P3Q8WZ94 311 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MSL2Q9HCI7 577 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DYNLRB1Q9NP97 96 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GHRLQ9UBU3 117 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SPATA2Q9UM82 520 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ETV7Q9Y603 341 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM210A6NLX4 147 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB108AA8MXU0 73 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 E7EQL1 145 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 LILRA1O75019 489 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PLAUP00749 431 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CSTBP04080 98 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GRPP07492 148 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CFPP27918 469 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TALDO1P37837 337 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PTGFRP43088 359 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 HAAOP46952 286 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR3A4PP47883 348 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 EVX1P49640 407 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GPR176Q14439 515 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MKXQ8IYA7 352 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR10AD1Q8NGE0 317 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 S100ZQ8WXG8 99 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FBXW5Q969U6 566 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FAM3DQ96BQ1 224 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ITPKCQ96DU7 683 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DIRC2Q96SL1 478 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CST11Q9H112 138 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 METTL9Q9H1A3 318 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0B4J203 849 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LRP5LA4QPB2 252 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 A6NLC8 198 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 B9A039 149 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 H0YL77 283 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 M0R233 179 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SPRY3O43610 288 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HPGDSO60760 199 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 KDM4BO94953 1096 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 BPNT1O95861 308 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PAHP00439 452 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IGFBP2P18065 325 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 THBS2P35442 1172 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SRP9P49458 86 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ART1P52961 327 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RSU1Q15404 277 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FAM189A2Q15884 450 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF611Q8N823 705 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SAMD12Q8N8I0 201 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR4D6Q8NGJ1 314 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HPSE2Q8WWQ2 592 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 NEUROG1Q92886 237 aa10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms