RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326197.11

SCMH1-201, Transcript of Scm polycomb group protein homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCMH1, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1-201ENST00000326197 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
SCMH1-201ENST00000326197 S100PBPQ96BU1 408 aa8.96□□□□□ -0.97
SCMH1-201ENST00000326197 DDIT4LQ96D03 193 aa8.96□□□□□ -0.97
SCMH1-201ENST00000326197 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
SCMH1-201ENST00000326197 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.96□□□□□ -0.97
SCMH1-201ENST00000326197 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.96□□□□□ -0.97
SCMH1-201ENST00000326197 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.96□□□□□ -0.97
SCMH1-201ENST00000326197 C5orf52A6NGY3 159 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR2C1O95371 312 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DDAH2O95865 285 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MPZP25189 248 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OPRM1P35372 400 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TMEM50BP56557 158 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GABREP78334 506 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.96□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MS4A18H0YCH9 400 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 AP4M1O00189 453 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FCGR3AP08637 254 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OMGP23515 440 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PTGER4P35408 488 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SULT1A1P50225 295 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FZD2Q14332 565 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CLINT1Q14677 625 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 BTNL8Q6UX41 500 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF721Q8TF20 911 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SPSB2Q99619 263 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CD5P06127 495 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CHATP28329 748 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ACY1Q03154 408 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR5B2Q96R09 309 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR51M1Q9H341 326 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PADI1Q9ULC6 663 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 A0A1W2PNR3 127 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 H7C1Q1 480 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LINC01565O15544 149 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CLN5O75503 358 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 YIF1AO95070 293 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 IGHG1P01857 330 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ACKR3P25106 362 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RAB5CP51148 216 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FOXF1Q12946 379 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ACER2Q5QJU3 275 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ERGIC1Q969X5 290 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 REEP6Q96HR9 211 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LRRC61Q9BV99 259 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LANCL2Q9NS86 450 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.95□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FAM221AA4D161 298 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 WRBO00258 174 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 UBE2CO00762 179 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TSPAN2O60636 221 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PIGPP57054 158 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 QRFPP83859 136 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 KISS1Q15726 138 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PCK2Q16822 640 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 KCNK17Q96T54 332 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms