RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 CD63P08962 238 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FPR2P25090 351 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FBXO17Q96EF6 278 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TPT1P13693 172 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 EIF1P41567 113 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-201ENST00000311626 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-201ENST00000311626 GJC3Q8NFK1 279 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SAP25Q8TEE9 199 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 MR1Q95460 341 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 S100A13Q99584 98 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 NELFAQ9H3P2 528 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PROK2Q9HC23 129 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 COL6A3P12111 3177 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 MUC3AQ02505 3323 aa22.18■■□□□ 1.14
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HOXB3-201ENST00000311626 CCL4P13236 92 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 RRADP55042 308 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FAM122CQ6P4D5 195 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 LHFPL1Q86WI0 220 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FAM89BQ8N5H3 189 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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HOXB3-201ENST00000311626 PIGMQ9H3S5 423 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 F8VVB4 439 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 F8VWA3 439 aa22.18■■□□□ 1.14
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HOXB3-201ENST00000311626 UMODP07911 640 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PRF1P14222 555 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 H3F3AP84243 136 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 DYRK2Q92630 601 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 DHRS3O75911 302 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 RPS2P15880 293 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM218A2RU14 115 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 M0R135 149 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PTGER4P35408 488 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ACTBL2Q562R1 376 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF799Q96GE5 643 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SRXN1Q9BYN0 137 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 RAB18Q9NP72 206 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 A0A0J9YW62 118 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 MSTNO14793 375 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ZNHIT1O43257 154 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 DHHO43323 396 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM225BP0DP42 221 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ACKR3P25106 362 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 DKKL1Q9UK85 242 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FGF16O43320 207 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 NAT2P11245 290 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 LSM6P62312 80 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 CYCSP99999 105 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PDSS1Q5T2R2 415 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 BATF2Q8N1L9 274 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SHDQ96IW2 340 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FAAP24Q9BTP7 215 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ATG12O94817 140 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 NTF4P34130 210 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 OPRM1P35372 400 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PDCD1Q15116 288 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 CLEC9AQ6UXN8 241 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ZIC4Q8N9L1 334 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SGK3Q96BR1 496 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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HOXB3-201ENST00000311626 HRH4Q9H3N8 390 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 FAM221AA4D161 298 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SERPINA5P05154 406 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 GLI4P10075 376 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ADH6P28332 368 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 HGFACQ04756 655 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TAF9Q16594 264 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PRSS54Q6PEW0 395 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 Q7L0L9 218 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 SLC30A7Q8NEW0 376 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 IFI44Q8TCB0 444 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM54Q969K7 222 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 V9GYS6 101 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 IGLV3-1P01715 115 aa22.14■■□□□ 1.14
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