RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 NTF3P20783 257 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CD96P40200 585 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PMP22Q01453 160 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 Q7L0L9 218 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CARFQ8N187 725 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPQ1 181 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CST7O76096 145 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SFT2D2O95562 160 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 FGF7P21781 194 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GNB1P62873 340 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 INSL4Q14641 139 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS42Q7Z5A4 293 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN32Q96QS1 320 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GNB4Q9HAV0 340 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 XKRY2A2RUG3 117 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PTHLHP12272 177 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PTGFRP43088 359 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GPM6AP51674 278 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 FMODQ06828 376 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP18Q8NEJ0 188 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRG7Q96K78 797 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GPR37O15354 613 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GPBAR1Q8TDU6 330 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1E2Q96JD6 320 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 EDEM2Q9BV94 578 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SCN9AQ15858 1988 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 RPL11P62913 178 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GUK1Q16774 197 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 VN1R4Q7Z5H5 301 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 COX14Q96I36 57 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 NDFIP1Q9BT67 221 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 MMP26Q9NRE1 261 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF15O95150 251 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 LY86O95711 162 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 RFC3P40938 356 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ZIC1Q15915 447 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM215Q68D42 235 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 THSD4Q6ZMP0 1018 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf47Q8NEP4 570 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3IP1Q96FE7 263 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 H3BP45 60 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SFTA3P0C7M3 94 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 DMRTC1Q5HYR2 192 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 MASP2O00187 686 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1C3P42330 323 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PJVKQ0ZLH3 352 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R1AQ13522 171 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T2Q6IF00 324 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN23Q96B33 292 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf57Q99622 126 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PHYHIPLQ96FC7 376 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 MAP6Q96JE9 813 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 OCIAD1Q9NX40 245 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 OR8D4Q8NGM9 314 aa18.89■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A2Q6IF42 318 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZS52 159 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM104Q8NE00 496 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TAAR9Q96RI9 348 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 AQP7P3A6NL99 342 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SEC14L6B5MCN3 397 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ST8SIA5O15466 376 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf17Q53FE4 359 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf152Q5JTZ5 239 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF320A2RRD8 509 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 IL11RAQ14626 422 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42EP2O14613 210 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 RER1O15258 196 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 LRRTM1Q86UE6 522 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC8Q8IUA0 241 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 FBP1P09467 338 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 RAB5AP20339 215 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MVDP53602 400 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MIDNQ504T8 468 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 BCORQ6W2J9 1755 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 HPP00738 406 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-BQ31612 363 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 SP6Q3SY56 376 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 OR1L3Q8NH93 324 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 RAB40CQ96S21 281 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 RASL12Q9NYN1 266 aa18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 220.4 ms