RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 C2orf72A6NCS6 295 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 AP4M1O00189 453 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 CYTIPO60759 359 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 HPNP05981 417 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SAP25Q8TEE9 199 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 PRRX2Q99811 253 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ZFP92A6NM28 416 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 C4orf47A7E2U8 309 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 CD300LBA8K4G0 201 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SCGB1D1O95968 90 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 P04436 131 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 DBHP09172 617 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC25A4P12235 298 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 NFYBP25208 207 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 DUSP1P28562 367 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 PNLIPRP2P54317 469 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 C4orf17Q53FE4 359 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM209BQ5JX69 171 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 FAHD2AQ96GK7 314 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SGCZQ96LD1 299 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 GAB2Q9UQC2 676 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SCN2AQ99250 2005 aa10.29□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 MPTX1A8MV57 137 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 CYB5BO43169 146 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 LAT2Q9GZY6 243 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 RAB27BO00194 218 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SFT2D2O95562 160 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 CD1AP06126 327 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 AWAT1Q58HT5 328 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 C9orf152Q5JTZ5 239 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SHEQ5VZ18 495 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR137CQ8N3F9 429 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A0G2JK05 382 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PPH5 198 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 PHOX2AO14813 284 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ABOP16442 354 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 MSX1P28360 303 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 MFAP5Q13361 173 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2T2Q6IF00 324 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ZAR1Q86SH2 424 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 OR1N1Q8NGS0 311 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 MITD1Q8WV92 249 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 PBOV1Q9GZY1 135 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 SMOC1Q9H4F8 434 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR84Q9NQS5 396 aa10.28□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 PIN1P1O15428 100 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ARG1P05089 322 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 GUSBP08236 651 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 DAOP14920 347 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 FPR2P25090 351 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 HSF1Q00613 529 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 C17orf67Q0P5P2 114 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 FUT7Q11130 342 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 TAF9Q16594 264 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 NCMAPQ5T1S8 102 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 DOK3Q7L591 496 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 WNT2BQ93097 391 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 OPA3Q9H6K4 179 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.27□□□□□ -0.76
CLSTN3-201ENST00000266546 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PR64 198 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PRV1 198 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2M5A3KFT3 312 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 C7orf77A4D0Y5 90 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 A6NLC8 198 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 C4orf51C9J302 202 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 FZD5Q13467 585 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 ADIRFQ15847 76 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC23A3Q6PIS1 610 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 TUBG2Q9NRH3 451 aa10.27□□□□□ -0.77
CLSTN3-201ENST00000266546 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms