RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 ARRDC1Q8N5I2 433 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRH-201ENST00000263434 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF160Q9HCG1 818 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM100Q9NV29 134 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRH-201ENST00000263434 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRH-201ENST00000263434 SRPK3Q9UPE1 567 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 OR2J2O76002 312 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 FPR2P25090 351 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PHLDA2Q53GA4 152 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 FANCFQ9NPI8 374 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM225BP0DP42 221 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ADH6P28332 368 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CAV2P51636 162 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM33P57088 247 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 FNDC9Q8TBE3 224 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 DHRS7CA6NNS2 312 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ZNHIT1O43257 154 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SGCEO43556 437 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 RD3LP0DJH9 198 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 HKR1P10072 659 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TAF9Q16594 264 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PCK2Q16822 640 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SULF2Q8IWU5 870 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ERGIC1Q969X5 290 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 KIRREL1Q96J84 757 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 COA4Q9NYJ1 87 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 MFNGO00587 321 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TSPAN15O95858 294 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PNLIPP16233 465 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF708P17019 499 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 OR2B8PP59922 312 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 POC1AQ8NBT0 407 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 OR2AE1Q8NHA4 323 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ST8SIA1Q92185 356 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 IP6K3Q96PC2 410 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 GPR173Q9NS66 373 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ALKBH4Q9NXW9 302 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CA14Q9ULX7 337 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 WIF1Q9Y5W5 379 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 A6NLC8 198 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF850A8MQ14 1090 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TIAF1O95411 115 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ARG1P05089 322 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CD37P11049 281 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TBPP20226 339 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 THEM4Q5T1C6 240 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 FAAP24Q9BTP7 215 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PECRQ9BY49 303 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 IFT22Q9H7X7 185 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PIGLQ9Y2B2 252 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PMS2P1A4D2B8 440 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TXNL1O43396 289 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SCGNO76038 276 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 IFNA2P01563 188 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 CBX5P45973 191 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 IL34Q6ZMJ4 242 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 Q7L0L9 218 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PPP1R3BQ86XI6 285 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF441Q8N8Z8 693 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 RFNGQ9Y644 331 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1W2PR64 198 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1W2PRV1 198 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PET100P0DJ07 73 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 GPR85P60893 370 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 NAAAQ02083 359 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 SPEM2Q0P670 501 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2V2Q15819 145 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 MIDNQ504T8 468 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 VAX1Q5SQQ9 334 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRH-201ENST00000263434 PLXDC1Q8IUK5 500 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms