RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262805.16

PDE4C-201, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 2,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-201ENST00000262805 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 K7ESF4 209 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 MSR1P21757 451 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 CSNK1A1P48729 337 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 SLC35A1P78382 337 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 PCOLCEQ15113 449 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 RAB19A4D1S5 217 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 CCL3P10147 92 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 STARD6P59095 220 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 MST1LQ2TV78 715 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4C-201ENST00000262805 CTSSP25774 331 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PTGER4P35408 488 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 UQCC3Q6UW78 93 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 POC1AQ8NBT0 407 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 NELFAQ9H3P2 528 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 V9GYS6 101 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 DHRS3O75911 302 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF205O95201 554 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LYL1P12980 280 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PNLIPP16233 465 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GABRR1P24046 479 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 S100A10P60903 97 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 IL15RAQ13261 267 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PROK2Q9HC23 129 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ADH6P28332 368 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 NAAAQ02083 359 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RAET1LQ5VY80 246 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GJC3Q8NFK1 279 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CHST5Q9GZS9 411 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SFTPBP07988 381 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 THBS4P35443 961 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CBX5P45973 191 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CBLN2Q8IUK8 224 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM123Q8N131 208 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RNF141Q8WVD5 230 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM54Q969K7 222 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 FBXO17Q96EF6 278 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 C2orf50Q96LR7 162 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ONECUT2O95948 504 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ACKR3P25106 362 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ALDH3B1P43353 468 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TAS2R46P59540 309 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SPEM2Q0P670 501 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 C10orf128Q5T292 105 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SHDQ96IW2 340 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 AQP10Q96PS8 301 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PIGQQ9BRB3 760 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GPR173Q9NS66 373 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 A0A0U1RQV5 110 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 M0R135 149 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ANGPTL7O43827 346 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ZIC3O60481 467 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 UMODP07911 640 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 OR2A2Q6IF42 318 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.61□□□□□ -0.07
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