RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 K7N7A8 449 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 OR5H8P0DN80 308 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 PVRP15151 417 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 MYOGP15173 224 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 FIGLAQ6QHK4 219 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 OR14J1Q9UGF5 321 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 MBPP02686 304 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 CHRM2P08172 466 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 RND3P61587 244 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 DCXRQ7Z4W1 244 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 RHBDD1Q8TEB9 315 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 HDAC8Q9BY41 377 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 METTL9Q9H1A3 318 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D29Q9UFV1 150 aa18.77■□□□□ 0.6
ODC1-201ENST00000234111 DIRAS3O95661 229 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 BGLAPP02818 100 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 PGA4P0DJD7 388 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 PGA5P0DJD9 388 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 DRD3P35462 400 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ASCL1P50553 236 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FAM210BQ96KR6 192 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 LIPGQ9Y5X9 500 aa18.77■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 E5RGE8 158 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TGFBR3LH3BV60 316 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SOX15O60248 233 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SRP19P09132 144 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 GJA4P35212 333 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 GLIPR1P48060 266 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SNU13P55769 128 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 RAB38P57729 211 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 LILRA6Q6PI73 481 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SGPP2Q8IWX5 399 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZNF440Q8IYI8 595 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FAM3CQ92520 227 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 S1PR5Q9H228 398 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SIRT7Q9NRC8 400 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SUSD2Q9UGT4 822 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 NSG2Q9Y328 171 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 IL18BPO95998 194 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 IFNA21P01568 189 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SLC22A25Q6T423 547 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CENPMQ9NSP4 180 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.76■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZNF117Q03924 483 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 BEND2Q8NDZ0 799 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 C16orf52Q8NHV5 167 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZNF519Q8TB69 540 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SMDT1Q9H4I9 107 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 MBP02144 154 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ACY1Q03154 408 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TVP23CQ96ET8 276 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SERGEFQ9UGK8 458 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SRPK3Q9UPE1 567 aa18.75■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 NOTCH4Q99466 2003 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CCDC187A0A096LP49 1063 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CDC14BO60729 498 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 IFI6P09912 130 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 MDKP21741 143 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 C5orf34Q96MH7 638 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 GPR137BO60478 399 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 WISP1O95388 367 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CD200P41217 278 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 OR3A4PP47883 348 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 LANCL3Q6ZV70 420 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 RNF208Q9H0X6 261 aa18.74■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 GLO1Q04760 184 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FNDC7Q5VTL7 733 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 AGBL4Q5VU57 503 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SPSB3Q6PJ21 355 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TMEM59Q9BXS4 323 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SNHG12Q9BXW3 62 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms