RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 CHST5Q9GZS9 411 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR10A2Q9H208 303 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 IFT46Q9NQC8 304 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR14I1A6ND48 311 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 K7ENP7 123 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 RAD51DO75771 328 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR2A4O95047 310 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 HPNP05981 417 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 TPOP07202 933 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR4E1P0C645 316 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 HRH1P35367 487 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 CLDN18P56856 261 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PSG4Q00888 419 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 RAB3CQ96E17 227 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR2A7Q96R45 310 aa15.8■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 SCGNO76038 276 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 FCGR2AP12318 317 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PTGFRP43088 359 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 Q6ZSR3 168 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 SKA3Q8IX90 412 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 CITED4Q96RK1 184 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 GPR173Q9NS66 373 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 UPB1Q9UBR1 384 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 VSIG4Q9Y279 399 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR6C6A6NF89 314 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 APOC1P02654 83 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 CHRM2P08172 466 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 ZNF35P13682 527 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 HTR5AP47898 357 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 GSK3AP49840 483 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 DRAM2Q6UX65 266 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 MDS2Q8NDY4 140 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PP6455Q8WZ26 134 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 REEP6Q96HR9 211 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 DISC1C4P0D8 188 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PMP2P02689 132 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 SERPINA2P20848 420 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 MEF2DQ14814 521 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 C3AR1Q16581 482 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR2H1Q9GZK4 316 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 NUP50Q9UKX7 468 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.78■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 CEACAM4O75871 244 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 MPC2O95563 127 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 LCATP04180 440 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 RAP2BP61225 183 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PMP22Q01453 160 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 PLGLB1Q02325 96 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 TEX261Q6UWH6 196 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 OPN4Q9UHM6 478 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 U3KQ87 197 aa15.77■□□□□ 0.12
USP18-201ENST00000215794 ZNHIT1O43257 154 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 SP1P08047 785 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 TMPRSS3P57727 454 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 IKZF1Q13422 519 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 OR51T1Q8NGJ9 327 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 HAS2Q92819 552 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 SLC2A8Q9NY64 477 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 LUZP4Q9P127 313 aa15.77■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 MFNGO00587 321 aa15.76■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 UBBP0CG47 229 aa15.76■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 MGMTP16455 207 aa15.76■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 ZNF708P17019 499 aa15.76■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 CXCL2P19875 107 aa15.76■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 TNFSF10P50591 281 aa15.76■□□□□ 0.11
USP18-201ENST00000215794 TBR1Q16650 682 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms