RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 WIPF3A6NGB9 483 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 NGFP01138 241 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CGAP01215 116 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM225BP0DP42 221 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 GTF2F2P13984 249 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TAS2R19P59542 299 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CD163Q86VB7 1156 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM89BQ8N5H3 189 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM229BQ8NBD8 167 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 OR56B4Q8NH76 319 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM57AQ8TBR7 257 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CMBLQ96DG6 245 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 NICN1Q9BSH3 213 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 SELENOIQ9C0D9 397 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 MCUBQ9NWR8 336 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM215AQ9Y5M1 114 aa18.51■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TRAV6A0A075B6T7 132 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 A0A0A6YYD4 124 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 A0A1W2PP11 408 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CCNKO75909 580 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 IL2RAP01589 272 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 MGMTP16455 207 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TIMP3P35625 211 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 WNT5AP41221 380 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 P2RY6Q15077 328 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM255AQ5JRV8 349 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 RAB3CQ96E17 227 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TM2D1Q9BX74 207 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 METTL9Q9H1A3 318 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.5■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 MEIS3P1A6NDR6 274 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ICMTO60725 284 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CST4P01036 141 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 H2AFB2P0C5Z0 115 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ASCL4Q6XD76 172 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 BEND4Q6ZU67 534 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 OR51T1Q8NGJ9 327 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TOXO94900 526 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CYB5AP00167 134 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CBR1P16152 277 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 SERPINA2P20848 420 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 RCVRNP35243 200 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 RAB25P57735 213 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 FJX1Q86VR8 437 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF610Q8N9Z0 462 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 OR4C16Q8NGL9 310 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 C20orf85Q9H1P6 137 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CDH20Q9HBT6 801 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 OBP2BQ9NPH6 170 aa18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF850A8MQ14 1090 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 GNB3P16520 340 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CPT2P23786 658 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 STEAP1BQ6NZ63 245 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 Q8NA96 180 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 PXT1Q8NFP0 134 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 WBP1Q96G27 269 aa18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 C7orf66A4D0T2 115 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 SOCS1O15524 211 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ARL6IP1Q15041 203 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 RSU1Q15404 277 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 OR10K1Q8NGX5 313 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 OR6F1Q8NGZ6 308 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 IL36GQ9NZH8 169 aa18.47■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CD300LBA8K4G0 201 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CD3DP04234 171 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 TDGF1P3P51864 188 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 PRDX4Q13162 271 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 FAAP20Q6NZ36 180 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 WDR31Q8NA23 367 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 POFUT1Q9H488 388 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 GPR160Q9UJ42 338 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 MGAQ8IWI9 3026 aa18.46■□□□□ 0.55
RHBDD2-201ENST00000006777 A0A1W2PR80 420 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms