RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1447Q8VFX3 309 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr558Q8VGZ7 317 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AldobQ91Y97 364 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Egln1Q91YE3 400 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tssk6Q925K9 273 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbx19Q99ME7 446 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Washc3Q9CR27 194 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkiras2Q9CR56 191 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r100Q9EPS5 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r171Q9EPS6 316 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk1b27Q9JM71 263 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MthfrQ9WU20 654 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fnd3c2A2AP83 941 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14409A2ARR8 349 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13102A2ASJ3 519 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp362B1ASA5 418 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp707F6QUN2 391 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstp3F6RWR5 210 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ClockO08785 855 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Neu1O35657 409 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MbP04247 154 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fth1P09528 182 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdkn1bP46414 197 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GifP52787 417 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actg1P63260 375 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox14Q04892 240 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrfn1Q2WF71 766 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf48Q3US17 591 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmprss13Q5U405 543 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc29a2Q61672 456 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist2h2abQ64522 130 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uhrf2Q7TMI3 803 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chst2Q80WV3 530 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prap1Q80XD8 149 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem255aQ8BHW5 351 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fhl4Q8CDC8 279 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4763Q8CFJ5 196 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dmrtc2Q8CGW9 370 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp87Q8K2A4 540 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r8Q8R2C2 303 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med9Q8VCS6 142 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pofut1Q91ZW2 393 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt7Q99P30 236 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SmpxQ9DC77 85 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stard10Q9JMD3 291 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nupr1Q9WTK0 80 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Timm8a1Q9WVA2 97 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ch25hQ9Z0F5 298 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RfxankQ9Z205 269 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm17190V9GX38 357 aa9.44□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex28B1AYN9 409 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5901D3YVJ1 333 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr520E9Q518 316 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8871F7AXK2 190 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21913J3KML9 361 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21776J3QPJ5 361 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VipP32648 170 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il18P70380 192 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ErfP70459 551 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Otx1P80205 355 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6760Q0ZNK3 87 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr616Q3KPB0 317 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk10Q3UMM4 360 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spag8Q3V0Q6 470 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss44Q402U7 372 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nufip2Q5F2E7 692 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrm3Q5ND52 418 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox17Q61473 419 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RimklaQ6PFX8 380 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr782Q7TRI2 314 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr728Q7TRM6 311 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr358Q7TRY5 330 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PimregQ8BFY7 231 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1230Q8VG58 305 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1240Q8VG73 314 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1257Q8VGP0 309 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr683Q8VGV1 319 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plrg1Q922V4 513 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xrcc2Q9CX47 278 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CygbQ9CX80 190 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tssk4Q9D411 328 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl7l1Q9D8M4 246 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ApooQ9DCZ4 198 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aqp5Q9WTY4 265 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl10Q9Z0H7 233 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rspo1Q9Z132 265 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgs6Q9Z2H2 472 aa9.43□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrnA0A075B668 197 aa9.42□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 KprpB2RUR4 657 aa9.42□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp942B8JJA7 486 aa9.42□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrr1D3YY91 422 aa9.42□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdr1E9Q0B4 517 aa9.42□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex264E9Q137 309 aa9.42□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm2174F6ZVF2 133 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.2 ms