RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	IL2RA	P01589	272 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MGMT	P16455	207 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	AMY2B	P19961	511 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GSK3A	P49840	483 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ECH1	Q13011	328 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	S100A13	Q99584	98 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS3	O75911	302 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINF1	P36955	418 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FOLR3	P41439	243 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	STAR	P49675	285 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM123	Q8N131	208 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0D9SG52	128 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MFNG	O00587	321 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NR2C1	P13056	603 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GABRR1	P24046	479 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CALCR	P30988	508 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NTF4	P34130	210 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR3A2	P47893	321 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM54	Q969K7	222 aa		11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ADAP1	O75689	374 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CBR3	O75828	277 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MPZ	P25189	248 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MLF1	P58340	268 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf128	Q5T292	105 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	STPG2	Q8N412	459 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CRLF2	Q9HC73	371 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GPR173	Q9NS66	373 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	KNTC1	P50748	2209 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	VAMP5	O95183	116 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TBP	P20226	339 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZP3	P21754	424 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	RAC1	P63000	192 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.47	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ANGPTL7	O43827	346 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALT1	P15291	398 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF84	P51523	738 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MC2R	Q01718	297 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	EHF	Q9NZC4	300 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR2F2	O95006	317 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	HP	P00738	406 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	HPN	P05981	417 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	UBB	P0CG47	229 aa		11.46	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GLRA1	P23415	457 aa		11.46	□□□□□ -0.57

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