RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R129	80 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFSF11	O14788	317 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF264	O43296	627 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ACHE	P22303	614 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT5A	P41221	380 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	CRISP1	P54107	249 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TLE4	Q04727	773 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	VMAC	Q2NL98	169 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	THEM6	Q8WUY1	208 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF524	Q96C55	264 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM100	Q9NV29	134 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ASB6	Q9NWX5	421 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ASIC5	Q9NY37	505 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	STARD10	Q9Y365	291 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	KPTN	Q9Y664	436 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		6.4	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WUJ7	227 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	SERINC4	A6NH21	518 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF726	A6NNF4	738 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495		J3QKU1	62 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	OGG1	O15527	345 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	NCR1	O76036	304 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR2C	P28335	458 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ART1	P52961	327 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	RAP1B	P61224	184 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	GTF3C1	Q12789	2109 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ULK3	Q6PHR2	472 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGX	Q8TBF5	258 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM210B	Q96KR6	192 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	OR14A2	Q96R54	314 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	RERGL	Q9H628	205 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	PROK2	Q9HC23	129 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5H1	A6NKK0	313 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	MFNG	O00587	321 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R2P9	O14990	202 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	CXCL13	O43927	109 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK2	P20151	261 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	RAD52	P43351	418 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	MVD	P53602	400 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	EGR3	Q06889	387 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	VEZF1	Q14119	521 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	CEBPE	Q15744	281 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	REEP3	Q6NUK4	255 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF14	Q92956	283 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	RNFT2	Q96EX2	444 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	LAT2	Q9GZY6	243 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10A4	Q9H209	315 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	CNIH4	Q9P003	139 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	GGT3P	A6NGU5	568 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495		J3KTA2	159 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	GABRP	O00591	440 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC14B	O60729	498 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB1D2	O95969	90 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN15	P56746	228 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8NFD4	153 aa		6.39	□□□□□ -1.39
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		6.39	□□□□□ -1.39

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