RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611278.4

ZNF248-208, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF248, Length 4,204 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-208ENST00000611278 FABP1P07148 127 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 MSMBP08118 114 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 GAS1P54826 345 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 FGL1Q08830 312 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 OR4F5Q8NH21 305 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 POC1BQ8TC44 478 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 PTP4A1Q93096 173 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 PGAM5Q96HS1 289 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 PRRC1Q96M27 445 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 EMC6Q9BV81 110 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 TREM2Q9NZC2 230 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 V9GYH0 126 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 UBE2QL1A1L167 161 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 TPST2O60704 377 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 PNPP00491 289 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 IL1AP01583 271 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 LIPFP07098 398 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 CECR9P0C854 216 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF79Q15937 498 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 ELP2Q6IA86 826 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 PGAP1Q75T13 922 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM17Q86X19 198 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 TMED9Q9BVK6 235 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.4□□□□□ -1.22
ZNF248-208ENST00000611278 PDZD2O15018 2839 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 UNC119BA6NIH7 251 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PTP4A3O75365 173 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 GADD45GO95257 159 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 CLPSP04118 112 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 RHCEP18577 417 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 SELENOPP49908 381 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 NRN1LQ496H8 165 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 SYT9Q86SS6 491 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 OR51A7Q8NH64 312 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 ERGIC1Q969X5 290 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 HIVEP1P15822 2718 aa7.4□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 E7EQL1 145 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 NDUFB3O43676 98 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 OR1E2P47887 323 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 Q6ZTK2 550 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF225Q9UK10 706 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PLA2G10O15496 165 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 SOX14O95416 240 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PLAUP00749 431 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 BPIFB3P59826 476 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 KDM8Q8N371 416 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 UPRTQ96BW1 309 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 FUZQ9BT04 418 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 KNG1P01042 644 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 CGAP01215 116 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 IGHV4-39P01824 125 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 SCG5P05408 212 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 EPHA1P21709 976 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 BDH1Q02338 343 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 OR2M2Q96R28 347 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 PFDN5Q99471 154 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 NPAS1Q99742 590 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 NOX3Q9HBY0 568 aa7.39□□□□□ -1.23
ZNF248-208ENST00000611278 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms