RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 OMPP47874 163 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 TGM4P49221 684 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 HMGA2P52926 109 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 ACSM1Q08AH1 577 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 MICBQ29980 383 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 STUMQ69YW2 141 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 WDR82Q6UXN9 313 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 OR2T12Q8NG77 320 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 LZICQ8WZA0 190 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 FN3KQ9H479 309 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.09□□□□□ -1.27
TTR-204ENST00000610404 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 UNC119BA6NIH7 251 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 M0R1W7 72 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 MRASO14807 208 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ZNF682O95780 498 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SLC2A1P11166 492 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 RPS6KA3P51812 740 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 BMXP51813 675 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 GMFBP60983 142 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SEC23BQ15437 767 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 DGUOKQ16854 277 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SLC36A3Q495N2 470 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 IFI44LQ53G44 452 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 RRM2BQ7LG56 351 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 BVESQ8NE79 360 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 OR4K13Q8NH42 304 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 PIFOQ8TCI5 191 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 GAFA1Q96PS6 74 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 OR4F4Q96R69 305 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.08□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PQ09 198 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 OR6C68A6NDL8 312 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 CDIPTO14735 213 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ANGPTL7O43827 346 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 RENP00797 406 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 HLA-DQA2P01906 255 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 GRK5P34947 590 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 PRKXP51817 358 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 KRTAP10-11P60412 298 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 MZT1Q08AG7 82 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 COQ5Q5HYK3 327 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 FGD3Q5JSP0 725 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 DRAM2Q6UX65 266 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 Q8N2B8 174 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 OR8S1Q8NH09 359 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SPTSSAQ969W0 71 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SPSB4Q96A44 273 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 RAB18Q9NP72 206 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 CMTM6Q9NX76 183 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.07□□□□□ -1.28
TTR-204ENST00000610404 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms