RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 DHFR2Q86XF0 187 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR6S1Q8NH40 331 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR52J3Q8NH60 311 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 HSD17B8Q92506 261 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ASB9Q96DX5 294 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 SGTBQ96EQ0 304 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OXGR1Q96P68 337 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 EMC6Q9BV81 110 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FKRPQ9H9S5 495 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 NANSQ9NR45 359 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MED29Q9NX70 200 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MALT1Q9UDY8 824 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MED31Q9Y3C7 131 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PR80 420 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PDLIM1O00151 329 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ACOT8O14734 319 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 RNF13O43567 381 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 UPK3AO75631 287 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR7A10O76100 309 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF432O94892 652 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR6A2O95222 327 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TGFAP01135 160 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FAM157CP0CG43 387 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FCGR1AP12314 374 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 AREGP15514 252 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 COX5AP20674 150 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 IL32P24001 234 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 IFNA8P32881 189 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 AQP2P41181 271 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 BIDP55957 195 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PRKCDQ05655 676 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 STK11Q15831 433 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ADCK1Q86TW2 530 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM123Q8N131 208 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR2M2Q96R28 347 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM129A0AVI4 362 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CIB4A0PJX0 185 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CDC42EP2O14613 210 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 KRT33AO76009 404 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GADD45GO95257 159 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 EPHA2P29317 976 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RRM2P31350 389 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEA2P43356 314 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PDLIM4P50479 330 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FHL1Q13642 323 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 DGCR6Q14129 220 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FLOT2Q14254 428 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 P2RY6Q15077 328 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TAB1Q15750 504 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR52N5Q8NH56 324 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR51A7Q8NH64 312 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 REG4Q9BYZ8 158 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FANCFQ9NPI8 374 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 VNN3Q9NY84 501 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms