RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 SLC2A1P11166 492 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 CBR1P16152 277 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 RAB3AP20336 220 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 STOMP27105 288 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 TALDO1P37837 337 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SLC6A9P48067 706 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 IFITM3Q01628 133 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 HGFACQ04756 655 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 GSG1Q2KHT4 349 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SNAI3Q3KNW1 292 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 TMEM42Q69YG0 159 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 TMEM211Q6ICI0 200 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 VWA1Q6PCB0 445 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 CD163Q86VB7 1156 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ZNF584Q8IVC4 421 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SAMD12Q8N8I0 201 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 OR5H6Q8NGV6 325 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ZNF671Q8TAW3 534 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 C15orf40Q8WUR7 153 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SLC7A6Q92536 515 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 OPA3Q9H6K4 179 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 LIN7BQ9HAP6 207 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 FBLN5Q9UBX5 448 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 PROCRQ9UNN8 238 aa10.31□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 MED12LQ86YW9 2145 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 C5orf63A6NC05 138 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 MSTNO14793 375 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 LDLRAD4O15165 306 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 CTDSPLO15194 276 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SULT1B1O43704 296 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 LMX1BO60663 402 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 PAHP00439 452 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 HLA-DQB1P01920 261 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ZNF20P17024 532 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 TUBG1P23258 451 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ANOS1P23352 680 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 GNALP38405 381 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ALDH3B1P43353 468 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 MAP2K3P46734 347 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 OR8B8Q15620 311 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SFRP5Q5T4F7 317 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 HES5Q5TA89 166 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 OR5AS1Q8N127 324 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SETD6Q8TBK2 473 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 RND1Q92730 232 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 TECTBQ96PL2 329 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SORCS2Q96PQ0 1159 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 CHST5Q9GZS9 411 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 PIGMQ9H3S5 423 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 NOX3Q9HBY0 568 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 TUBG2Q9NRH3 451 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.3□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 A0A0A6YYH2 397 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 A6NJ64 397 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 A6NNC1 897 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 CD79AP11912 226 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 HTR2CP28335 458 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 OPRM1P35372 400 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 PITPNBP48739 271 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 FAM3AP98173 230 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 PITPNAQ00169 270 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 RAB11BQ15907 218 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 RGS21Q2M5E4 152 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 HACD4Q5VWC8 232 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 WDR31Q8NA23 367 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 DNAAF1Q8NEP3 725 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 OR51A2Q8NGJ7 313 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 FAM3DQ96BQ1 224 aa10.29□□□□□ -0.76
GGA3-217ENST00000583667 HAVCR1Q96D42 359 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms