RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560246.1

FAM227B-210, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene FAM227B, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-210ENST00000560246 PITPNBP48739 271 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 SNCBQ16143 134 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ASRGL1Q7L266 308 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 GID4Q8IVV7 300 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 Q8TCH9 128 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PIGCQ92535 297 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 SPSB4Q96A44 273 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 MICU1Q9BPX6 476 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RGCCQ9H4X1 137 aa11.5□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 SRRM5B3KS81 715 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PHYHO14832 338 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ATP6V1E1P36543 226 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PSMB10P40306 273 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 CXCR4P61073 352 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ACTR3P61158 418 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 FGF12P61328 243 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 KCNJ8Q15842 424 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 OCLNQ16625 522 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 C12orf73Q69YU5 71 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 Q6YL49 198 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 OR8B12Q8NGG6 310 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 OR51G2Q8NGK0 314 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 TECTBQ96PL2 329 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 TBX5Q99593 518 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PKP2Q99959 881 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 CLN8Q9UBY8 286 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 COPS3Q9UNS2 423 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.49□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 GPR37O15354 613 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 BPIFB3P59826 476 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 GMFBP60983 142 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RELBQ01201 579 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 IL5RAQ01344 420 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PRDX4Q13162 271 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 LRRC29Q8WV35 223 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 OR8B4Q96RC9 309 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 NOX4Q9NPH5 578 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.48□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 A0A1B0GUS0 222 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 OOEPA6NGQ2 149 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 LGALS8O00214 317 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ADAM20O43506 726 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF254O75437 659 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 GYPAP02724 150 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 MMP9P14780 707 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 MAP2K3P46734 347 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 CDC42P60953 191 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 POU4F2Q12837 409 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 MIDNQ504T8 468 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 GPR157Q5UAW9 335 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RNF170Q96K19 258 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 LYZL4Q96KX0 146 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 APOL4Q9BPW4 351 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 PBOV1Q9GZY1 135 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.47□□□□□ -0.57
FAM227B-210ENST00000560246 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms