RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 NAA40Q86UY6 237 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR5AS1Q8N127 324 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 GPER1Q99527 375 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CCDC160A6NGH7 325 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR5B21A6NL26 309 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 A6NLC8 198 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 TMEM210A6NLX4 147 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 SPRY3O43610 288 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ZFPL1O95159 310 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CST4P01036 141 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ADRA2AP08913 450 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PSKH1P11801 424 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CAPZA1P52907 286 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ATP1B3P54709 279 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 FAM3AP98173 230 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 TPBGQ13641 420 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR8B8Q15620 311 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 KCNJ8Q15842 424 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 MOB3CQ70IA8 216 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ZNF573Q86YE8 665 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ERGIC1Q969X5 290 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 TMEM106AQ96A25 262 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 SPSB1Q96BD6 273 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 FGGYQ96C11 551 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 BORCS8Q96FH0 119 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 TIMD4Q96H15 378 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR5M11Q96RB7 305 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 C17orf100A8MU93 164 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 INMTO95050 263 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PNPP00491 289 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PLAUP00749 431 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 IFNA2P01563 188 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CSF3P09919 207 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CD36P16671 472 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CCL1P22362 96 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CA6P23280 308 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 SOX2P48431 317 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 FUT6P51993 359 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 GNG3P63215 75 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PRDX4Q13162 271 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 DOC2BQ14184 412 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 HFEQ30201 348 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 Q5PR19 223 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 UTS2BQ765I0 119 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 TMEM203Q969S6 136 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 RNF170Q96K19 258 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 IL19Q9UHD0 177 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 GLS2Q9UI32 602 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 STUB1Q9UNE7 303 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 V9GYS6 101 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-218ENST00000550159 E9PI62 339 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms