RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T27Q8NH04 317 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF799Q96GE5 643 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF570Q96NI8 536 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSSK2Q96PF2 358 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUAK2Q9H093 628 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YY1AP1Q9H869 796 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SP140LQ9H930 580 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USE1Q9NZ43 259 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VAPAQ9P0L0 249 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5F1O95221 314 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGA5P0DJD9 388 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC2A1P11166 492 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPNP16150 400 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFX4Q33E94 735 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF626Q68DY1 528 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR6V1Q8N148 313 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8U1Q8NH10 309 aa8.01□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFCAB9A8MZ26 197 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BSH0 61 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOCS2O14508 198 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNA6P05013 189 aa8□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KITP10721 976 aa8□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLRA1P23415 457 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPIBQ01892 262 aa8□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHL1Q13642 323 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNMB1Q16558 191 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC18B1Q6NT16 456 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EGFL6Q8IUX8 553 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL17DQ8TAD2 202 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAMM41Q96BW9 452 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA25Q9BR10 227 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf21Q9H246 121 aa8□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZIM2Q9NZV7 527 aa8□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EVPLLA8MZ36 301 aa7.99□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBX1O43435 398 aa7.99□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD14P08571 375 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1E2P47887 323 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKXP51817 358 aa7.99□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP51A1Q16850 503 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRMQ8IXM6 262 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPTSSAQ969W0 71 aa7.99□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP12Q9Y561 859 aa7.99□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf98A8MV24 154 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A2O15244 555 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AHCYL1O43865 530 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEDDO75618 318 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2F2O95006 317 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DQA2P01906 255 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPX2P18283 190 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FSTP19883 344 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU3F4P49335 361 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC7A2P52569 658 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTA2P62736 377 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTG2P63267 376 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTC1P68032 377 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTA1P68133 377 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35B1P78383 322 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBX1P83916 185 aa7.98□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.98□□□□□ -1.13
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