RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534307.1

SF3B2-215, Transcript of splicing factor 3b subunit 2, human

TSL 3

Gene SF3B2, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B2-215	ENST00000534307	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SF3B2-215	ENST00000534307	PKP2	Q99959	881 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SF3B2-215	ENST00000534307	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SF3B2-215	ENST00000534307	ABCB9	Q9NP78	766 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SF3B2-215	ENST00000534307	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SF3B2-215	ENST00000534307	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SF3B2-215	ENST00000534307	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307		A0A1B0GW55	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	CLDN34	H7C241	214 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	CDIPT	O14735	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZNF254	O75437	659 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	FCGR1A	P12314	374 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	AMY2B	P19961	511 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	PRTN3	P24158	256 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	POU4F2	Q12837	409 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	CD276	Q5ZPR3	534 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	CIB1	Q99828	191 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	MRO	Q9BYG7	248 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TMEM210	A6NLX4	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DVL1	O14640	695 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	LIPF	P07098	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	SFTPB	P07988	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	MICB	Q29980	383 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	STUM	Q69YW2	141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TBX15	Q96SF7	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TMPRSS2	O15393	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	TTR	P02766	147 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	PIGC	Q92535	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	WDFY2	Q96P53	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	MNT	Q99583	582 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	CCL13	Q99616	98 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	GPR84	Q9NQS5	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SF3B2-215	ENST00000534307	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms