RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ACER3-213	ENST00000533873	ZFHX3	Q15911	3703 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ACER3-213	ENST00000533873	CR1	P17927	2039 aa		5.84	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZAN	Q9Y493	2812 aa		5.84	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0G2JMP0	313 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0X1KG70	313 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TVP23A	A6NH52	213 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		H3BS24	57 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GPANK1	O95872	356 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ACSM4	P0C7M7	580 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IL7	P13232	177 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OSM	P13725	252 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IRF2	P14316	349 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GATA3	P23771	443 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	COL8A2	P25067	703 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	HSD11B1	P28845	292 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	THBS2	P35442	1172 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GABARAPL2	P60520	117 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IFITM3	Q01628	133 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MZT1	Q08AG7	82 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ATP6AP1	Q15904	470 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	AVPI1	Q5T686	147 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR2T2	Q6IF00	324 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PGAP1	Q75T13	922 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SHF	Q7M4L6	423 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NOXA1	Q86UR1	476 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR5AS1	Q8N127	324 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FTMT	Q8N4E7	242 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR8G5	Q8NG78	346 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM186	Q96B77	213 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM80	Q96HE8	168 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	APOL4	Q9BPW4	351 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TOR3A	Q9H497	397 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CENPM	Q9NSP4	180 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM100	Q9NV29	134 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IL19	Q9UHD0	177 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GGT3P	A6NGU5	568 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RNF212B	A8MTL3	300 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		J3QLI3	93 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PRODH	O43272	600 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	XRCC2	O43543	280 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFA2	O43678	99 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FOXH1	O75593	365 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TIPRL	O75663	272 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PNP	P00491	289 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PF4	P02776	101 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GYPB	P06028	91 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PSKH1	P11801	424 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CPT2	P23786	658 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FAS	P25445	335 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IL2RG	P31785	369 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	BTG1	P62324	171 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	BAMBI	Q13145	260 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GINS1	Q14691	196 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR8G1	Q15617	311 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	KLHL12	Q53G59	568 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IGSF11	Q5DX21	431 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TOR2A	Q5JU69	321 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TEX30	Q5JUR7	227 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LIPN	Q5VXI9	398 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48

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